在污水處理廠內，污水和污泥中含有很多有害的化學物質生物成分，它們直接危害操作人員及直接接觸者的健康。
　　
　　1．微有機體
　　
　　員工在污水處理廠暴露于污水和污泥中的微有機體面前，有可能受到如下健康威脅：?甲型肝炎病毒→與原污水和初級污泥接觸者獲得機會較大
　　
　　?微螺旋體病毒→泵站及水收集系統工人易感染
　　
　　?寄生蟲感染→泵站及水收集系統工人易感染
　　
　　?其他病毒感染→高度暴露的工人易感染
　　
　　?胃腸道疾病→剛參加工作的員工
　　
　　?與泥堆積有關→鼻子、耳朵、皮膚異常
　　
　　污水處理設施產生的霧氣、水氣等都能傳播細菌和病毒。感染可能由于直接吸入的氣體或間接沾到皮膚或衣服上的水滴感染。曝氣池、出水堰、灌溉的噴水口、鼓風機房、脫水機房等都會凝結這種氣體。在水氣高度凝結的地方，使用薄紗型呼吸器會減少有毒物質的吸入。
　　
　　避免所有的起因是不可能的，良好的個人衛生習慣和健康的免疫保護都會減少細菌和病毒感染的機會。防御細菌和病毒感染最好的辦法是具有良好的個人衛生習慣。提高防護效果需依靠科學的環境處理、良好的人個衛生習慣以及正確的操作方法執導：
　　
　?。?、手和手指遠離鼻子、嘴、眼睛和耳朵。
　　
　?。病⑶逑垂ぷ?、處理污水、處理格柵柵渣、排除污泥，或做其他直接接觸污水和污泥的操作時都要戴膠皮手套。
　　
　　３、手被劃傷、燒傷或皮膚破損時，要戴手套工作。
　　
　?。?、吃東西、吸煙和工作完成后，要用熱水和香皂徹底洗手。
　　
　?。?、指甲要短，要用小刷子洗掉指甲上的異物。
　　
　　６、把干凈衣服、上下班更換的衣服與用過的工作服分開放置。
　　
　?。贰⒐ぷ鲿r若受傷應及時上報并接受緊急處理。
　　
　　８、每天工作后淋浴。
　　
　　2．化學物質（氣體和化學藥品）
　　
　　氣體和蒸汽產生于細菌活動、工業釋放后溶解到水中的氣體及揮發性有機化學物質的蒸發。這些氣體如果大量存在，有可能引起燃燒、爆炸、毒性擴散或導致呼吸者生病。特別是空氣不流通，缺少大氣稀釋的特定空間更容易聚集有毒氣體。
　　
　　化學藥品主要針對污水的化學處理部分。應當遵守一定的操作規則、規章和法令。操作者應具備識別潛在化學有害物及其危害程度的能力。管理者應制定有效的預防措施控制有害物質的釋放。大多數化學物質能被安全地存儲和處理，人們也知道它們潛在的危害性，采取適當的預防和防護措施是防止有害化學物質危害的有效方法。