在檢測能力方面：重點提升所轄區域內主要農產品、農業投入品和產地環境等方面有關安全衛生參數的確證檢測能力；檢測范圍要能夠完全覆蓋對主要農產品生產全過程質量安全檢測范圍；要能夠滿足按我國國家標準、行業標準、地方標準對農產品質量、安全、工藝、性能等參數進行檢測的需要；檢測效率在原有基礎上提高5倍以上，檢測規模達到40~60萬項次/年。
??? 　　在檢測水平方面：對產地環境、投入品和所轄區域內主要農產品的檢測方面，檢出限、準確度等應能夠100%滿足我國各級標準的相關要求；主要農產品的90%以上檢測參數的最小檢出限和檢測精度符合國際標準的要求，80%以上檢測參數的最小檢出限和檢測精度符合日本、美國和歐盟等世界最發達國家或地區的要求，出口優勢農產品的關鍵質量安全參數的最小檢出限和檢測精度要100%滿足國際標準要求；農藥多殘留檢測水平達到150種成分。總體技術水平應達到國外發達國家的中等水平。
??? 　　5. 縣級質檢站
??? 　　縣級質檢站主要以開展現場快速檢測、指導地方農業生產為目的，直接面向廣大農業生產者和農產品消費者，重點承擔所轄區域范圍內農產品生產基地、批發市場、農貿市場等方面的農產品質量安全日常性檢測工作。
??? 　　在實驗條件方面：以服務當地農戶、加強農產品質量監管與無公害農產品生產技術推廣為目的，根據本縣或本區域內的農產品特色，開展貼近地方農業生產的公益性快速檢測，重點配備農（畜）產品質量安全速測和農業生態環境監測所需的基本設備，以農產品及環境采樣、樣品前處理、常規檢測、快速檢測儀器設備為主。并配置前處理等設備。在實驗室建設方面，要在現有基礎上根據不同產品類別及檢測參數對環境的要求進行合理分區，對實驗室的水電氣條件，試劑及樣品存放、設備布局、溫濕度控制、防火、樣品消化和通風排氣、照明、“三廢”處理和安全等設施進行系統設計和改造，實驗室面積一般應在300～500平方米，控溫控濕面積在100平方米以上。
??? 　　在檢測能力方面：能夠滿足農田土壤、灌溉及養殖用水中主要易于變化的常規污染與肥力指標、農產品中高毒農藥的定性速測的需要；不僅要建設固定實驗室的檢測能力，還要注重流動實驗室檢測能力的建設，以達到輻射監測區域內生產基地、農貿市場、批發市場中農產品質量安全的目的。
??? 　　（五）農產品質量安全檢驗檢測體系的功能與布局
??? 　　到2010年，共建設1個農業部農產品質量標準與檢測技術研究中心（以下簡稱為部級研究中心）；42個部級專業性農產品質量安全監督檢驗中心；15個部級優勢農產品區域性質量安全監督檢驗中心； 36個省級綜合性農產品質量安全監督檢驗中心；1200個縣級農產品質量安全監督檢驗站（以下簡稱為縣級質檢站）。各級農產品質量安全檢驗檢測機構均為技術性、事業性、公益性和非營利性機構。各類機構功能職責如下：
??? 　　1.部級研究中心
??? 　　農產品質量安全與標準的政策、法律法規、發展戰略和規劃等研究；農產品質量安全風險分析理論和關鍵技術研究；農產品質量安全檢測及評價技術與設備的研發；農產品貿易技術壁壘預警體系建設和快速反應機制研究；農產品質量安全和管理的綜合性和基礎性標準的制修訂，以及相關專業性標準制修訂工作的組織協調和技術支持；全國農產品質量安全例行監控、普查等工作的組織協調和技術支持；開展農產品質量標準和檢測技術的國際合作與交流；參與農業國際標準化組織的活動，參加和承擔有關農產品國際標準的制修訂工作；組織和協調全國農產品質量安全與標準研究專家隊伍，開展有關農產品質量安全和農業標準化方面的國內外學術交流。
??? 　　2．部級專業性質檢中心
??? 　　立足本專業，突出和發揮專業優勢，在相應領域內重點開展以下工作：全國農產品質量安全普查、例行監測等任務；開展國內外農產品質量安全風險分析與評估工作；專業性農產品檢驗檢測技術的研發和標準的制修訂；國內外農產品質量安全對比分析研究和國內外合作與交流；質量安全重大事故、糾紛的調查、鑒定和評價；質量安全認證檢驗、仲裁檢驗和其他委托檢驗任務；負責有關專業農產品質量安全方面的技術咨詢和技術服務，為區域性質檢中心、省級綜合性質檢中心等提供專業技術服務和人才培訓。
??? 　　3．部級區域性質檢中心
??? 　　應立足本區域，突出對優勢農產品從生產基地、投入品到農產品生產全過程的質量安全檢驗檢測和指導服務，承擔相應區域范圍內優勢農產品市場準入、委托檢驗和仲裁檢驗等檢驗檢測工作，負責對區域內優勢農產品產地環境進行例行監測、現狀評價與污染預警工作，實現就近取材、隨時檢測、同類型優勢農產品大批量檢測和特有質量安全參數的深度檢測。
??? 　　4. 省級綜合質檢中心
??? 　　突出省域內職責，主要承擔省域內主要農產品質量安全監督抽查檢驗、市場準入性檢驗檢測、產地認定檢驗和評價鑒定檢驗，負責對縣級檢測站進行技術指導和技術培訓，接受其他委托檢驗和負責省域內農產品質量安全方面的技術咨詢、技術服務等工作。
??? 　　5. 縣級質檢站
??? 　　突出農產品質量安全執法檢驗、日常性檢驗、農產品質量安全標準的宣傳和對千家萬戶農產品生產指導職能，負責指導農產品生產基地、農貿市場、批發市場和連鎖超市的檢驗檢測和技術培訓工作，承擔對廣大農民和農產品生產者質量安全方面的標準宣傳貫徹、技術培訓、技術咨詢和技術服務工作。
??? 　　四、農產品質量安全檢驗檢測體系建設內容
??? 　　全國農產品質量安全檢驗檢測體系建設必須滿足對農產品產前、產中和產后三個主要環節進行質量安全監控和監控技術研究的需要。全國農產品質量安全檢驗檢測體系的主要建設內容是儀器設備的配備和檢測實驗室的改擴建。在建設的過程中，各質檢機構應根據其所服務的產品對象、承擔的職責任務、現有條件，以及所需要達到的相應檢測能力和技術水平，按照需要有針對性地進行建設。
??? 　　（一）儀器設備條件建設
??? 　　在充分利用各質檢機構現有儀器設備的基礎上，根據各級農產品質檢機構的工作需要，更新、配置部分高檔精密儀器設備，使檢測儀器設備的精度和量程能夠滿足新形勢農產品質量安全監管的需要。新增的儀器設備，堅持先進、可靠、經濟適用的原則，同時確保有一定的超前性。
??? 　　（二）實驗室條件建設
??? 　　除農業部農產品質量標準與檢測研究中心為新建單位，需要新建研究及辦公場所外，其余各質檢機構檢測實驗室的建設以改建和擴建為主。各質檢機構應按照所承擔的職責任務和配置儀器設備的情況，對檢測實驗室和工作間進行必要的改建或擴建，使建設后的檢測實驗室能夠在使用面積、布局和環境條件等方面與所承擔的檢測任務相適應。
??? 　　五、農產品質量安全檢驗檢測體系建設標準
??? 　　（一）部級研究中心
??? 　　此研究中心的建設目標是建成國內權威并與國際接軌的農產品質量標準與檢測研究機構，技術能力要能夠滿足農產品質量安全危害分析和風險評估的需要，能夠滿足對農產品質量、安全、工藝、性能等參數進行分析和比對研究的要求，能夠滿足我國主要農產品生產、市場貿易和消費全過程實施質量安全監控的需要，能夠應對農產品國際貿易中技術壁壘的挑戰。因此，在儀器設備的配置上，必須瞄準國際一流水平，配備一定量的高端儀器設備，以建立現代化的農產品質量安全分析測試技術手段。儀器設備配置的重點是用于農產品質量安全風險評估和新的檢測技術方法研究等方面的各種高、精、尖分析測試儀器，以及數據采集、處理和加工設備。
??? 　　試驗和辦公條件建設，按照國際同類國家級質量安全檢測研究機構的水平進行建設。
??? 　　（二）部級專業性質檢中心
??? 　　部級專業性質檢中心新增的儀器設備，堅持先進、可靠和與國際接軌的原則，關鍵儀器設備從國外引進。
??? 　　（1）農業產出品類部級專業性質檢中心
??? 　　-- 植物產品：重點配置用于農產品中農藥殘留、重金屬污染等有毒有害成分定性、定量和危害性分析的儀器設備；農產品中氨基酸、維生素等質量成分或功能成分分析的儀器設備；農產品檢測樣品前處理設備；病毒檢測設備；速測設備；樣品采集與運輸設備；測試數據處理設備等。
??? 　　-- 畜禽產品：配置用于畜產品中獸藥、重金屬、農藥及瘦肉精等有毒有害物質殘留分析和微生物檢測的設備；畜禽良種基因品種測定、鑒定設備；牧草品種分析設備；畜牧獸醫器械質量分析設備；畜禽產品檢測樣品前處理設備；速測設備；樣品采集與運輸設備；測試數據處理設備等。
??? 　　-- 水產品：重點配置用于水產品中藥物殘留、生物毒素、病原微生物、重金屬等有毒有害物質定性、定量和危害性分析的設備；水產品中氨基酸等質量成分或功能成分分析的設備；水產品檢測樣品前處理設備；速測設備；樣品采集與運輸設備；測試數據處理設備等。
??? 　　（2）農業投入品類部級專業性質檢中心
??? 　　-- 種子種苗：配置用于動植物及微生物品種品質檢測的設備；新品種真實性鑒定設備；轉基因品種快速檢測設備；檢測樣品前處理設備；測試數據處理設備等。
??? 　　-- 肥料：配置用于肥料產品質量檢測，特別是新型微生物肥料、各種復合類葉面肥料檢測所需要的儀器設備；配方施肥檢測設備；肥料對土壤、地面水、地下水造成危害的檢測設備；測試數據處理設備等。
??? 　　-- 農藥、獸藥：配置用于農藥、獸藥產品質量鑒定及檢測的儀器設備；農藥、獸藥殘留前處理及檢測的儀器設備；農藥殘留及畜禽糞便中殘留獸藥對土壤、地面水、地下水殘留造成危害的檢測設備；測試數據處理設備等。
??? 　　-- 飼料及添加劑：配置用于飼料有效成份測定、新型飼料添加劑鑒定、有毒有害物質殘留量測定、飼料及添加劑風險評估等儀器設備。
??? 　　（3）農業生態環境類部級專業性質檢中心
??? 　　配置用于野外采樣及運輸的設備，包括土壤采樣設備、大氣采樣器、水樣采集器、樣品保存、運輸設備等；用于現場分析測試的設備；用于水、土、氣樣品前處理的設備；實驗室用于水、土、氣中污染物分析的儀器設備。包括土壤、農用城市垃圾、工業固體廢棄物、農用水（灌溉用水、畜禽養殖用水、漁業養殖用水）污染分析測試設備及農區（養殖場）大氣污染分析測試設備；分析測試數據處理設備等。
??? 　　部級專業性質檢中心的實驗室，要參照國際同類實驗室的條件和水平進行改擴建。根據不同檢測參數對環境的要求對實驗室進行合理分區，對水電氣條件、試劑及樣品存放、設備布局、溫濕度控制、防火、防塵、防震、噪聲和電磁輻射控制、通風排氣、照明、“三廢”處理和安全等設施進行系統設計與改造。部分質檢中心現有檢測實驗室面積小，業務用房少，可根據需要適當擴大。
??? 　　（三）部級區域性質檢中心
??? 　　--植物產品：配置用于檢測小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、甘蔗、柑橘、蘋果等優勢產品中氨基酸、維生素等質量成分或功能成分分析的儀器設備；農產品、產地環境、投入品中有毒有害成分定性、定量和危害性分析的儀器設備；農產品檢測樣品前處理設備；病毒檢測設備；速測設備；樣品采集與運輸設備；測試數據處理設備等。
??? 　　--畜禽產品：配置用于肉牛和肉羊、牛奶等優勢產品中重金屬、農藥、獸藥、飼料及產地環境中的有毒有害物質殘留分析和微生物檢測的設備；畜產品檢測樣品前處理設備；速測設備；樣品采集與運輸設備；測試數據處理設備等。
??? 　　--水產品：配置用于水產品中氨基酸等質量成分或功能成分分析的設備；水產品及產品環境中毒素和有毒有害物質定性、定量和危害性分析的檢測設備；水產品檢測樣品前處理設備；速測設備；樣品采集與運輸設備；測試數據處理設備等。
??? 　　實驗室的建設，是在現有基礎上根據不同檢測參數對環境的要求進行合理分區，對實驗室的水電氣條件、試劑及樣品存放、設備布局、溫濕度控制、防火、防塵、防震、噪聲和電磁輻射控制、通風排氣設施、照明、“三廢”處理和安全等設施進行系統設計和改造。
??? 　　（四）省級綜合性質檢中心
??? 　　省級綜合性質檢中心要重點圍繞保障本省農產品、農業投入品和農業生態環境監管和檢測的需要配備相應的儀器設備。
??? 　　實驗室的建設，是在現有基礎上根據不同檢測參數對環境的要求進行合理分區，對實驗室的水電氣條件，試劑及樣品存放、設備布局、溫濕度控制、防火、防塵、防震、噪聲和電磁輻射控制、通風排氣、照明、“三廢”處理和安全等設施進行系統設計與改造。部分實驗室檢測面積小，業務用房不足，可根據需要適當擴大。